《飞天小女警第六季》中，小女警们面临前所未有的挑战——被封印多年的邪恶泡泡意外复活。这个由泡泡的嫉妒心分裂出的黑暗分身，不仅拥有与泡泡相同的能力，更善于操控人心。她潜入小镇村，离间花花、毛毛和泡泡的友情，甚至诱骗她们各自使用超能力互相攻击。小女警们在一次次冲突中逐渐瓦解，小镇陷入混乱。关键时刻，尤教授发现了邪恶泡泡的弱点：她无法承受纯粹的善意。小女警们放下芥蒂，用信任和团结的力量净化了邪恶泡泡，但泡泡却因此失去了部分甜美的性格，变得更成熟坚毅。本季在探讨成长与自我接纳中落下帷幕。