第二季中，克拉克·肯特与露易丝·莱恩的关系愈发复杂，而大都会迎来新的威胁——神秘反派“暗影大师”操纵民众恐惧，制造混乱。超人发现对方竟是自己曾经的战友，因实验事故获得操控阴影的能力。为了阻止暗影大师的复仇计划，超人必须直面内心的黑暗面，同时保护露易丝不被牵连。在一场决战中，超人牺牲部分力量，以人性光辉唤醒对手良知，最终拯救城市。这一季探讨了英雄的孤独与成长，以及爱与信任的力量。