第二季中，百子在地面艰难求生，建立临时营地，却遭遇来自地面原住民“山地人”的致命袭击。与此同时，空间站“方舟”已无法维持，幸存者被迫降落到地球，与百子汇合。新旧力量碰撞，内部权力斗争与外部威胁交织，秘密逐渐浮出水面：山地人的真正目的、辐射背后的阴谋，以及百子中隐藏的叛徒。在生存与道德之间，每个人都要做出抉择。