第三季中，暗影猎人世界面临终极危机。Clary和Jace的关系因黑暗力量而岌岌可危，Valentine的阴谋与Lilith的复活让战火升级。Clary必须掌握天使之力，与伙伴们并肩作战，对抗堕落天使与恶魔军团。战斗中，Simon等人付出巨大牺牲，而Jace在黑暗与光明间挣扎。最终，Clary以自身为代价封印地狱之门，拯救了世界，但也失去了部分记忆。暗影猎人族群在悲痛与希望中重生，故事以悲壮而温暖的结局落幕。