在第二季中，少年君有云为寻找失散的亲人，踏上危机四伏的江湖之路。他先后结识了冷面剑客柳如烟和机关大师墨小蝶，三人组成小队，揭开了一场关乎武林存亡的阴谋。黑暗势力“暗影楼”企图利用上古神器控制各大门派，君有云等人必须赶在神器觉醒前阻止他们。途中，他们遭遇了背叛与牺牲，也收获了友情与成长。最终，君有云在绝境中领悟了剑道真谛，以凡人之躯撼动天命，守护了江湖的和平。